会战结束后的一个星期后，杨震在佳木斯军区新的驻地召开了战役总结会，以及下一步的工作部署。所有野战部队旅以上干部，地方部队军分区，除了留一名值班之外，全部按照总部要求参加会议。
在会议上杨震除了对会战中出现的各种问题进行了总结之外，还提出了今冬以及明年开春后，工作发展的目标。实际上杨震将工作计划订到的是自己知道的明年六月份苏德全面爆发当月。因为他也不知道，日本人会不会认为苏德战争爆发，自己外援通道被切断，而自以为有空子可钻。
按照目前形势的发展，杨震决定将部队继续划分为野战军和地方部队。野战军由四个纵队组成，每个纵队下辖四个步兵旅。同时组建军区装甲兵司令部、炮兵司令部以及航空兵司令部。
地方部队报请中央同意后，则组建合江军区以及松江军区、嫩江军区三个二级军区。各军分区不在由总部直属，而是划归二级军区建制。同时为了适应新的形势，军区在对现有各个分区进行一定调整的同时，也将新成立一批军分区。
在军分区调整上，杨震将老根据地的一、二、四三个军分区并入合江军区建制，三分区则并入新成立的松江军区。同时以原伪满滨江省辖区为基础组建五六两个军分区，龙江省辖区组建七八两个军分区。
以牡丹江、伪满东安省辖区组建直属军区建制的东安军分区和牡丹江军分区。而同时将二分区迁移到原伪满黑河境内，原二分区辖区转为一分区建制。牡丹江军分区、东安军分区因为地理位置重要，并不划归任何一个二级军区建制，由总部直属。
按照杨震的要求，地方部队除了在承担地方剿匪、保护工矿企业等重要目标，以及承担地方守备的任务之外，还要承担编制、整训地方武装的职能。在战时，可以直接转化为野战部队。每个军分区除了保留一个建制团的武装之外，还要有组建两个架子团。同时配合各县武装部承担征兵工作。
而两个直属总部的军分区，则是实打实的编组为三个团。这两个军分区，虽然只是旅级建制，但是由于目前战略位置至关重要，所以在所有军分区编制之中，是唯二保持满编建制的军分区。
这两个军分区不仅兵力配置与野战旅相等，而且这两个军分区，炮兵编制也与野战旅相同。同时为了保持对珲春以及伪满吉林省境内的日军保持一定的压力，这两个军分区还将各自编组一个骑兵营。
原本按照杨震的意思，这种直属军分区要编制四个的。除了牡丹江与东安之外，还要编成齐齐哈尔和双城两个军分区。但是在犹豫了一阵子后，还是决定将这两个军分区改为由军区野战部队，以及嫩江军区部队兼任守备任务。
在此次作战会议上，变化最大不是各个野战纵队，而是军分区一类的地方武装。此次会战结束后，杨震撤销了原各分区序列内的基干团，而是改为保留一个完整的建制团，其余的两个团则编成架子团，也就是后世所说的预备役部队。对于这些架子团，杨震的要求是在补充兵员后，必须能够拉得出、打的响。
在目前军区主力野战任务仍旧很重的前提之下，杨震还是决定将有限的兵员优先加强给野战纵队以及编组即将组建的装甲兵。至于地方部队，暂时也只能先编组一个满编团。其他额只能先编成两个架子团。
不过虽然各个军分区只能编成一个主力团，但是各县的县大队却全部升级，由原来的三个中队，扩编为四个中队。人员、装备全部按照野战部队的标准编制。同时各县的每个区也组建了连一级建制的区中队。
再加上每个县组建的属于直属社会部领导的各个公安局所指挥的公安中队，实际上分区武装是扩大了。这些县大队的经费、军装、武器虽然由军区统一拨付，但是所需的其他物资，如粮食、蔬菜、被服则由各县统筹供应。
而各个区中队，则作为受当地县委直管的地方不脱产武装。平时在家搞生产，每个月集中三到五天进行军事训练。各个区中队并不着装，则集中接替随时可以升级的原有县武装，担任本县的警备任务。
这样一来，在保持地方武装数量不减少的情况之下，军区的负担实际上是降低了。各个预备部队的数量，也比以前显著增加。更不会战时出现县大队被升级、拉走后，地方的警备力量出现空白的情况。
而各个野战纵队虽然依旧还只是四个纵队，并未增加编制，但是每个纵队却增加了一个旅的编制。同时在各个二级军区除了所属各个军分区之外，还编组了一个军区直属独立旅以及两个架子团性质的独立团。
这样一来，表面上看是编制还是四个纵队，但是在需要的时候，整个野战军在地方武装完成集中后，可以在短时间之内迅速在扩编两到三个纵队。各个纵队的第四旅，实际上与之前的影子部队类似。只不过他们的部队是整编部队，但是干部配置，却是按照两个旅配属的。
在公布完部队编制调整之后，杨震接着公布了各级指挥员调整的命令。四个纵队司令员、政委，除了二纵政委陈翰章调任军区刚刚组建的装甲兵司令部任司令员兼政委之外，其余的几个纵队军政主官人选并未改变。
而在旅一级，除了此次会战之中一批战功卓越的副旅职干部以及团职干部受到重用，被提拔为军分区司令员之外，