柯南也顾不上向小兰隐瞒了，这个涉及到全日本国防安全的间谍才是重中之重，他飞快地冲出了餐厅，是的，那个间谍x就是勇气的父亲。当那艘海难船出现之后，船长下令发射鱼·雷，之后神盾舰剧烈的摇晃，那个时候勇气是自己一个人，他的父亲没有跟在他身边，这引起了柯南的第一次注意，而那个人直到大家来到甲板上自由活动之后，才赶来与勇气汇合，这中间这么长的时间，足够他前去舰长室里面窃取情报了。想到这里，柯南也终于回想起刚才心中的那一丝违和感来自哪里，在餐厅里，那位自称是勇气父亲的男人给勇气拿了完整的一份午餐，可是之前在舰尾观看海鹰直升机升空的时候，勇气说过他对于牛奶制品之类的食物过敏，那么他是肯定不能喝牛奶的，可是这位“父亲”还是给他拿了一盒牛奶，这个人应该根本就不是勇气的父亲，只是绑架了他来要挟勇气，陪同自己一起登上神盾舰。
看着柯南跑出了餐厅，小兰的心里很不放心，“我有些担心，我要跟去看看，孩子们就拜托给你了，园子。”
在船舱里飞奔着的柯南接通了服部平次的电话，“工藤么？竹川丢弃在先斗町公园里的东西像是某种笔记。”
“笔记？”
“对啊，但是整个笔记几乎都被烧毁了，很难解读啊……”突然转角出现了藤井一佐和关口先生，两位情报保全队员，柯南赶快用手摁住了手表，躲到了一边，“听说竹川从大阪的淀屋桥站下车了……”
看两人已经走远了，柯南把手拿开，重新贴到了手表附近，“服部…服部……你听到了么？”
“什么？”
“竹川好像是去了大阪的淀屋桥站，你们赶快追过去，不能让他跑了。”
挂断了电话的柯南来到了甲板上面，他已经发现了勇气和他的那个“父亲”了，避开了那个男人的视线，小声地呼唤着勇气的名字，让他离开那个男人的身边，防止他成为间谍x的人质。吩咐勇气去找看守在甲板边缘的神盾舰船员寻求帮助，柯南独自来到了那个男人的身边，“雨宫先生……雨宫先生……雨宫先生……”整整呼唤了三次，那个男人才反应过来。
“哦，是你啊。”他显然也是对柯南有一定印象的。
“那个，勇气不要紧吧？”
“对了，勇气他又跑到哪里去了？”
“他说他的异位性皮肤炎发作了，所以先去厕所了。”
“皮肤炎？”
“像这种病必须要先去厕所把手洗干净，才能擦上随身携带的药，对吧？”
“啊，是啊，所以他去厕所了，我去看看他吧。”
“你在担心他么？那么为什么当时这艘神盾舰剧烈摇晃的时候，你却没有陪在勇气的身边？”
“我说过，那个时候我去厕所了……”
“你不是去厕所了，而是去舰长室窃取神盾舰的机密情报了，对吧？我刚刚已经叫了你三声雨宫先生了，你都没有反应过来，难道说你这个勇气的父亲和他的姓氏有所不同？另外勇气身上带着的药不是外用药膏，而是内服的药剂，因为他得的病不是异位性皮肤炎，而是食物过敏，而且还是对于牛奶过敏，你竟然还给他拿了一盒牛奶，做父亲的，不可能不知道这些事情，也就是说你并不是勇气的父亲，而是某个国家的间谍。”
“你究竟是什么人？”
“江户川柯南，是个侦探。”
“哈哈哈哈哈，侦探又如何？凭你一个小鬼头，又能做些什么？只要……”话没说完，x已经把手伸向了柯南，意图也很明显，就是要杀人灭口。为了躲避x攻击的柯南，身体向后倾斜，正准备用腰带发射出一个足球，来制服这个间谍，却好巧不巧地踩到了地上散落着的毛利小五郎的名片，摔到了地上。x露出了一个阴险的笑容，这次看你怎么躲……他的手已经朝着柯南的脖子伸了过来，“小弟弟，你没事吧？”x才惊觉到甲板上不是只有他们两个人存在，周围已经有很多游客围了过来，甚至还有一名海上自卫队的船员。x看了看场中的情况，此地不可久留，立刻朝着船舱的方向逃跑。
“别跑！”柯南正准备追上去，手臂却被人拽住了，是勇气，“不要再追了，不然他们会杀掉我爸爸的。”
柯南带着勇气找到了佐藤警官，说是找到了间谍x的踪迹，联系到了全部的搜查队员，“他说在他们出发之前，待在舞鹤湾的时候他的爸爸就不见了，才会和那个不认识的叔叔一起上船。”
“他说如果我不按照他说的话去做，他就要杀死我爸爸……”勇气的情绪很低落。“就是演习的时候，人不在cic里面的那个男子么？”佐藤警官询问道。
“我想那个人一定是趁着场面混乱，立石舰长来到cic里指挥战斗的工夫，来到了舰长室里面窃取演习相关的情报。”藤井一佐似乎是做出了与柯南类似的推理，很容易就想到了故事的全貌。
“也就是说，那个男子就是x！你还记得那个叔叔的长相么？”在场的办案人员都清楚勇气就是解开谜团的关键，但是勇气似乎并不是很想配合大家的行动，因为他觉得如果出卖了那个叔叔，他的爸爸就会死。“你能来协助我们么？”勇气低着头保持着沉默，柯南看了看他，“让我来吧！我还记得那个家伙的长相。”
“那么，就请你到cic看监视器的画面来帮我们找到他，可以吗？”
“好的！”<