光芒笼罩下，刘焱再一次听到了世界意志的声音。“病毒种数码兽将成为数码世界进化分支的一部分，同时数码兽进化方向主体变为疫苗种，对病毒种的攻击有伤害加成。数码世界的敌人是黑暗领域，所有骑士要做好保卫数码世界，防止黑暗领域大举入侵。”
光芒散去后，山顶的祭坛消失了。一同消失的，还有作为最初的病毒种数码兽，通天山上的那些病毒种数码兽全部化作资料消失了。
“真想不到，丧尸撒旦兽居然真的做到了这一点！”刘焱看着天上那扇渐渐闭合的大门，心中充满了矛盾。他们一百年的时间中，一直在和病毒种数码兽作斗争，达到了不死不休的程度，现在居然世界意志妥协了！
“话说，那扇大门到底是什么？为什么可以改变到这种程度？”灵狐问道，其他人也都看向刘焱，只有他才是最初的骑士，他们自然觉得刘焱可能会知道的更多一些。
刘焱想了想“或许就是世界本身所在的地方吧！不过现在不是我们能接触到的，大家都回去吧！既然世界意志已经改变了规则，我们也只能按照规则做事情了。黑暗领域不比病毒种数码兽，他们更加的强大，也更加的狡猾，未来会是什么样子，谁也说不清楚了。”
众人一阵沉默，召唤来各自的坐骑，再一次分别。一路上，刘焱看到有不少数码兽进化之后变成了病毒种，他们或是追求力量，或是充满破坏欲，这让刘焱下意识的出手将他们杀死了。之后想要顺手净化他们的时候才发现，这些数码兽的核心是不需要净化的。
来到了金属工厂，安杜路兽离开后指定了一个插头兽暂时取代了他的位置，而当刘焱来到这里的时候，他已经进化成了新的安杜路兽，带领着工厂中的数码兽进行着日常的工作。在他们的记忆中，只知道上一任安杜路兽离开了工厂，其余的什么都不知道。不仅仅是他们，就连那些和刘焱他们一起来到通天山的完全体数码兽们，也都不会再有之前关于病毒种的记忆，在心的记忆中，病毒种和他们疫苗种一样，是一种数码兽的进化方向而已。最多就是，感觉对病毒种数码兽天生有一种不爽的感觉。
叹了一口气，刘焱心中在思考着自己未来要走的路。继续按照现在的路走，接受世界意志的安排的使命保护数码世界，不断变强，又或者抛弃这个身份，从头开始？
想到这里，刘焱对红莲龙兽说道“你先回去吧！管理好火山区，如果有什么数码兽敢大肆破坏的话，直接灭掉，不用留情。”
“是，主人。”红莲龙兽说完便飞向了火山区，刘焱释放徽章的力量，面前出现了一个通道。一步跨入，刘焱已经来到了另一个地方。
感应到了刘焱的到来，一个身影从天而降“是你！”
刘焱看着来人“好久不见了，花仙兽。”这一次的世界更新后，机械花仙兽去除了机械化的外表，完全变成了花仙兽，妖精型数码兽，很适合照顾新生的数码兽。
“爆炎骑士兽大人您好，欢迎来到创始村，最近有不少的孩子出生，他们都很健康。”花仙兽一副下属汇报工作的样子让刘焱在心中叹了一口气“那么，第一次进化之后，有病毒向的数码兽很多吗？最终离开创始村的时候，这些数码兽又有多少会变成病毒种？”
花仙兽“大概有三成会直接进化成病毒种数码兽，如果算上第一次进化之后的话，可能会有五成数码兽最终会进化成病毒种。我最近在尝试用自己的花魔法来为孩子们传播正义的思想，这样应该可以减少他们向病毒种进化的几率。”
刘焱点了点头“你做的很好，辛苦你了，我先走了，你忙吧！”说完便离开了创始村。
“既然你能够接受这样的情况，为什么一开始一定要我们那么做呢？另外，丧尸撒旦兽到底做了什么，能让你产生这样的改变？”刘焱看着天空自言自语道。
此刻，其他的五位骑士心中多少都有些迷茫，自己的所作所为，转眼间就被否定了，这让他们有些怀疑世界意志的做法是对是错。
时间是冲淡一切的良药，距离上一次世界更新已经过去三百年了，病毒种数码兽已经成为了数码世界的一部分。每天都有数码兽进化成病毒种的方向，也有病毒种数码兽被杀死。相比于喜欢和平生活的疫苗种数码兽，病毒种数码兽不光喜欢破坏，还喜欢互相打架，所以死伤什么的很常见。
刘焱每隔一段时间就会清理一次火山区，将那些完全体的病毒种数码兽清除掉，顺带连一些强大的，快要到达进化边缘的成熟期一并处理掉。这样一来，会让火山区的范围内安稳上十几年。生活在这里的数码兽将这种情况称之为大清洗，疫苗种的数码兽会在这时间段中联合到一起杀死那些病毒种的数码兽。其他的地区刘焱不敢保证，但是他的辖区内，病毒种数码兽的整体实力是最低的！
深海，海皇殿内。白鲸王兽来到了殿内“主人，那几个完全体病毒种已经打算联合起来对付我们了，我们要不要先动手？”
如果说，刘焱是防患于未然的话，那海皇姬就是放任自流。只要病毒种数码兽不会大肆屠杀其他的数码兽她都不会亲自出手管。不过，她也让白鲸王兽以海皇殿的名义成立了一个势力，负责解决那些来挑战的病毒种数码兽。
久而久之，那些病毒种数码兽就不再单打独斗了，开始成立