流寇焚陵的消息传到京城，崇帝朱由检大惊失色，哀痛已极。“帝素服哭，遣官告庙，逮漕都御使杨一鹏弃市。
崇祯还在《罪己诏》中说:“流氛震惊皇陵，祖恫民仇，罪实在朕。”
天下普遍认为凤阳之被攻克，皇陵之被焚毁，是古今未有之奇变，君辱臣死之秋。然而，在强大的流寇面前，他们一筹莫展，畏葸不前。总督漕运兼巡抚朱大典以及官军中的总兵、参将、游击由于害怕被流寇歼灭，只是象征性地“率兵援剿”，流寇走后他们才敢去，没有一个有胆量与流寇正面交锋。“诸州官史，并无守御之策。”
时人梅之焕称：“凡到之处，逆奴、惯盗及游手游食之徒，从者如市。其辎重之多，供奉之侈，皆未可名状”。他哀叹“似此光景，抚之一字，亦无望矣！”
崇祯皇帝这次派出了他能派出的最强阵容，一方面命令五省总督，洪承畴率领他的部队全力进军，限时制敌，不可松懈。
另外则是命令朱大典为凤阳巡抚，卢九德为监军太监率领各部军队全力围剿攻入凤阳地区的流寇。
九德号双泉，扬州人，性勤干，谙练兵机。其把牌中军黄得功、朱纪，皆骁勇绝伦。”
朱大典和卢九德是公认的最强的组合，他们当年联手平定了吴桥兵变，是皇帝公认为最好的合作伙伴之一，这次皇陵被刨，乃大明皇朝，千古未有之奇变，所以他国难思良将，马上就想到了这一队组合，把他们派出去全力以赴的绞杀流寇。
但是这流寇势头如此之凶猛，即使是卢九德和朱大典都先后的抵达了凤阳附近，但是他们就是不敢大举进兵，全去招惹这些数10万的流寇军队。
他们手下不多，但是却是一些精锐的部队，毕竟人手不多，无法冲击对方数10万的大军阵容，不敢全力以赴的进攻对方，还得依靠洪承畴的部队抵达才行，洪承畴他的部队已经紧急的出潼关全力南下。
自从陈奇瑜下马以后，洪承畴挂兵部尚书衔，担任五省总督，这活可是不好干，因为前任陈奇瑜的才干也不见得在他之下，他的策略也是成功，眼见差不多就可以把流寇给剿灭，谁知道中了奸计，为敌所趁，终究是让对方才车相砸逃了出去。
这些当官的只能用城头变幻大王旗，眼前他楼起，眼见它由它楼塌，前两个月还是风光无限，指挥数10万军队全力围剿流寇的陈大帅，现在已经成为了阶下之囚，听朝廷的意思，还要把他下狱论死。
因为皇帝处死这些大臣可是从来不手软，如果有某位大臣蒙蔽了他，或者是办砸了差事，崇祯皇帝他可是毫不犹豫下狠手，直接的处死，比如说被皇帝素以砣磔刑的袁祟焕。
所以听到了皇帝诏令以后，洪承畴率领他的秦军全力的出潼关，追缴叛军，但是对的军队可是有十几万之人父，十几万军队的调动，那是无边无际，声势浩大的，也是不可能短期之内就能直接完成的。
现在他们都知道流寇的军队战斗力其实相当的强，如果没有绝对的优势，他们贸然冲过去差不多就是送人头，不单止没有剿灭对方，反而还会让对方反噬。
所以他们几路大军都十分谨慎，口号喊的震天响，但是却是畏缩不前，要等主力大军集结完毕以后才敢进攻，这就造成了流寇军队在凤阳地区治下的各个府大举的进攻，横行无忌，攻略四方的局面。