三天后，就在太平军定都天京的同一天，以张乐行为首的几股淮北捻军便从几个方向宣布起义。仅用了五天的时间，捻军便在内应的侧应下，采取应外合的方式攻了涡阳、毫州等地。占领毫州之后，离卦教正式更名为捻军，打出“除奸诛暴，救我残黎”的口号，一些原本在苏、皖、鲁、豫等地护送私盐的捻军纷纷响应。这些人都是些刀头过日子人，哪里将朝廷放在眼里。
捻军成立之后仿效满清八旗制度，以五色旗为标志分黄白红黑蓝色，捻军最高领导人称总旗主，又称大趟主，下设旗主、小旗主、趟主，大致按照捻子的形式伐分。攻克毫州之后，张乐行在雉河集招集各色旗主召开会议商定起义的未来的走向。当天张乐行被推举为捻军总旗主，自领黄旗起义军，黄旗总目，苏天福领黑旗，黑旗总目，龚得树领白蓝，白蓝旗总目侯士伟领红旗，红旗总目。起义军几天之内便招募了近万人开始在淮北一带的游动作战。
得到捻军起义的消息之后，肃顺大惊失色，一面感叹皇上的先见之明，一面询问从毫州赶来报信的人，起义军的原由。当听知是因为毫州知府为了讹人家的银子而导致了捻军起义之后，肃顺气不打一处来，当堂爆喝：“他娘的，老子在这三地辛苦了近一年时间就这混蛋一点贪念毁于一旦。”要不因为毫州知府在乱军之中被杀，肃顺真想将这斯碎尸万段。当气归气，眼下还得马上组织人马进行剿匪，不能让捻军与太平军汇合到一起，那时大清怕真的要完了。
不待多想，肃顺急忙下令河南等地官军集结待命，一面派人快马将消息传送至京城。北京城里，咸丰得到捻军起义的消息之后，不由大声感叹：“日防夜防，还是没能防住离北京最近的一股起义军。”感叹之后，咸丰连夜出城，直奔武卫军军营。当日下令让第一批在讲武堂进修的新军军官提前毕业，整军准备出师河南平捻。得到这个消息。最高兴的人大概就只有僧格林沁了。终于该论到他上场了。这个历史上一直到死都在与捻军对战的满清最后一位猛将，似乎真得与捻军有缘。
不等咸丰让新军誓师出征，得到淮北捻军胜利消息后，各地捻子们受到刺激纷纷群起响应。于是乎一时间，山东，河南等地不进有捻军起义发生。华大地上终于烽烟四起了。任肃顺再怎么能干，一时间被四处起义的捻军搞得晕头转向，不知所措。还好此时咸丰的圣旨帮了他一把。咸丰令肃顺马上收缩军队，防守各个要地，组织大军稳步进军，四处起义的捻军实行各个击破的战略。得到咸丰授意的肃顺顿时明了，将各地清军迅速收缩到各大主要城市里，对捻军实行坚壁清野的战略。瞬间各地捻军虽然节节胜利却始终好像不能发力一样，就好像一个拳手的一个重拳打到了一团棉花上一样。
捻军由于组成成分杂乱无章，各地头目旗主不能统一听令，纷纷各自行事，且多有市景无奈充斥其中，纪律奇差。部队到得一处便对当地进得一番抢夺，将男人裹协进起义军。由于咸丰早知道捻军纪律差，虽称农民起义军，其实与强盗无异，早吩咐肃顺将乡民收缩到大城里去了。于是乎捻军能抢夺的东西并不多，也不像历史那样混沌重生君临异界23488越打越多。
肃顺在被动防御了一阵之后，终于发现了捻军各自为主的缺点，在河南集中了一万余步军，五千余骑兵，将在河南境内作乱的刘六等几股小规模捻军快速扑灭，截断了南北捻军汇合的机会。 肃顺严格按照咸丰的命令收复一地，巩固一地的方法，渐渐将河南境内的捻军清除出去，首先安定的河南一地。至此，捻军只得在鲁、豫边境及淮北一地四处游动，无法真正汇合到一处。捻军提前分成了东西两股。
四月初，认识到捻军各自为主的作战形势对捻军的利，张乐行集结了西捻共五万余兵力试图攻破肃顺在河南的防线与东捻汇合。五万捻军声势浩大于四月初五，开始进攻河南永城。
“中堂大人，贼势浩大，巩永城难以坚守啊。”开封城内，肃顺得到了张乐行攻打永城的消息，马上招集文武商议对策。开封知府吴章之此时正满头大汗地说道。
“吴大人，这捻军除了淮北最严重就属你河南一地了。你到底给本钦差说说，这圣上的劝减新政到底实行的如何了？”肃顺见吴章之如此恐慌，却不正面回答他的话。
“这.”吴章之被问得一时无话可说。实际上，河南、山东等地，除了肃顺坐镇的山东对实行劝减新政的力度执行的很彻底外，其余两地大部分地方还是不像表面上看到的那样顺利，这也是为什么捻军在新政实行之后，还有瞬间招募到这么宠的队伍的原因之一。
“哼！你不要以为本钦差不知道。你们私底下干的好事，我是一清二楚，这回吃过苦头了，该知道圣上的决策的英明了？”肃顺用尖锐的目光看着吴章之道。这一年之中，肃顺虽然坐镇山东，对下面的人的动作其实是了然于胸的。只是碍于新政刚刚实行，有人一时想不通也是情有可原的，肃顺本等着山东一地做出了成绩来，可以刺激其他两地的执行力度，不想这时候发生的起义。
“是，是，是，下官今后定当全力维护新政，亲自督促执行，不敢有半点马虎。”被肃顺犀利的目光看得心慌的吴章之不由得连声称是。
“如此甚好，如今捻匪只是一时