夺下203高地后，其实旅顺俄军的败局已定，日军得以用要塞巨炮猛轰停泊在旅顺港内的俄国太平洋舰队。此时，乃木还在杞人忧天的调集兵力，准备拼其全力与俄军余部决一死战。但俄军已毫无斗志，乃木很快就意外地收到了俄军的乞降书。203战役后不到一周，俄驻旅顺要塞司令阿纳托利?米哈伊洛维奇?斯特塞尔派出军使，手持白旗，向日军递交投降书。翌日，乃木希典派第三军参谋长伊地知幸介与俄军达成协议，旅顺遂为日军占领。于是，被明治天皇力保的乃木希典司令官，就体面风光地完成了攻占旅顺要塞的战胜国司令官，接受俄军的投降，写了首著名的“水师营会见”的歌词，称乃木威严深沉，对败军之将显出宽厚仁慈，彬彬有礼，而俄军司令官则衷心盛赞其盖世武功。该歌生课本，而且被谱成曲，广为流传，塑造一个威严仁厚的日本军神形象。本来历史上起到关键作用的儿玉源太郎纯属打了一回酱油，灰溜溜的回到满洲军指挥部，大山岩虽然不忿乃木希典的糟糕表现，但是看着他能独立的指挥日军夺取旅顺要塞的战绩上，也只好捏着鼻子为他请功。
至于日军在占领203高地后，实际上已经掌握了旅顺战场上的主动权。从203高地上，日军很快运来要塞重炮，开始轰击港口内的俄军舰船和市区的俄军设施，俄太平洋舰队因此面临要么被击沉在港内，要么出港去自投罗的选择。在儿玉参谋长的干预下，日军改变了勇猛突击的路子，变得步步为营，加上武翼新军这两个标的步兵*运用掷弹筒和机枪、狙击枪进行近距离火力支援，迅疾攻克了一系列俄军要塞，接下来就是占领旅顺市区。
新年元旦，守军在俄军要塞司令斯捷塞尔将军的率领下，数万残兵败将向日军投降。直到此时，那支打酱油的俄太平洋第二舰队还航行在马达加斯加外海看狐猴呢。5月27日，当这支打算继续北上前往海参崴的俄国舰队在途经对马海峡时，守株待兔的东乡平八郎率领日本联合舰队予以迎头痛击，俄**队几乎全军覆灭，仅有“阿芙乐尔号”巡洋舰等几艘舰船侥幸逃脱。这一战日本海军也树立了自己的军神东乡元帅，不能让海军一向看不起的马粪们专美于前。至于仓皇逃命的“阿芙乐尔号”巡洋舰历尽艰险回到波罗的海的时候，已经是第二年的春天了，不过这艘身负重大历史使命的巡洋舰大难不死，缺敲响了罗曼诺夫王朝的丧钟，若是知道这样的结局，估计沙皇跪求东乡老大说啥也得把这艘丧门星给留在日本海当珊瑚礁啊。
在整个旅顺争夺战中，日军战死负伤达到了五万余人，俄军死伤四万五千左右左右，可谓是半斤八两。可是双方都忽略了武翼新军这支人数不多但是却总能搅动战局的力量，实际上武翼新军虽然战斗打了不少，伤亡却不算大。阵亡七百多人，负伤两千一百多人，其中致残退役的不到三百人，算下来整个参战部队中武翼新军一共投入不到一万兵力，但是战损三成左右，比起日俄动辄伤亡过半的情况还算可以接受吧。虽然吴宸轩也很心疼这些忠勇的将士伤亡，但是幸存下来的军人都经过了战火的淬炼，已经可以从容的面对生死，成为真正可以倚重的精兵强将。从这个意义上讲，这次参战吴宸轩已经是赚的盆满钵满了。