除此之外，周重为了能够让都察院更好的监察全国百官，特意把锦衣卫也暂时归入都察院的管理之下，如此一来，锦衣卫的情报机构也就能够为都察院所用，这一明一暗两个监察机构联手，所产生的能量可谓是十分恐怖，甚至毫不夸张的说，只要周重愿意，他可以最短的时间内将一个官员的底细查个清清楚楚，甚至连前天对方吃的什么饭都一清二楚。
当然了，锦衣卫归入都察院的管辖，这仅仅是权宜之计，等到日后周重将吏治整顿完成后，锦衣卫就会脱离都察院的管辖，至于对于日后锦衣卫的归属，周重也已经有了打算，那就是将锦衣卫打造成一个专业的情报机构，只负责情报的获取和收集，但却不能像以前那样拥有抓人和刑讯的权力。
短时间内，都察院就已经拥有了与其相匹配的权力，在这种巨大的权力下，京城和各地的御史们也纷纷开始了转变角色，行使自己的职权。特别是地方的监察御史，他们要把司法这一块从当地官府手中抢过来，毕竟这已经是他们都察院的职责，当然了，那些地方官员肯定不愿意看到自己手中的权力流失，所以这其中就引起不少争斗，不过监察御史本来就比较强势，又有锦衣卫这群爪牙相助，各地的官员很少难能够争的过监察御史，而且就算他们暂时保住了权力，日后的都察院也不会放过他们，所以还不如乖乖的交出来。
不过在都察院转变的过程中，也出现了不少问题，最主要的就是都察院的那些御史身上，有些御史的能力不足，无法跟着都察院的转变，对于这些人，周重只能无奈的将其调离都察院，然后从大理寺和刑部抽调得力的人手补充进来，另外还有一些地方的御史与当地官员狼狈为奸，根本不重视朝廷的法令，更不可能卖力为朝廷效力，对于这些人，周重自然是毫不留情，甚至在整顿吏治之初，第一批杀的官员就是这些御史。
都察院想要完全转变成周重希望的那个独立的司法机构，肯定需要相当长的一段时间，不过在周重将刑部与大理寺，以及地方的司法机构完全划归都察院之后，整个都察院已经具备了一定的独立性，再加上他们本来就有监督百官的职能，如此一来，一个独立监督大明行政权力的机构就完成了，而且正在行使着它的职能，这为周重整顿吏治也打下了一个坚实的基础。
都察院的变动虽然牵扯到整个大明的权力机关，但是相对来说还是比较容易的，一来都察院的权力本来就比较大，二来都察院本身也从中得利，所以都察院中的官员都对周重极其的支持，有了这些人支持，推动这项改革也就容易多了，至于另外一些官员的反对，自然有都察院的官员与他们打嘴仗，不过接下来的两项改革就十分麻烦了，甚至让周重也为之十分头痛。
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