天地之大，无边无际；红尘人心，无止无尽。神州浩土，广瀚无边；中原大地，丰美肥沃。在很久很久以前，世间有一正道门派，名唤灵真。
世人都想长生不老，渴望脱胎换骨，达到成仙人的境界，可是这里的秘密自古以来从未有过人参破。世间有三大正道门派，分别是灵真、九阳、月寒。这里是从灵真门开始说起。
起初，在中原，有一座大山，山连绵百里，峰峦起伏，高耸入云，平日里只见白云环绕山腰，不识山顶真容。此山山林密布，飞瀑奇岩，珍禽异兽，在所多有，景色幽险奇峻，且山的周围布满了灵气，天下闻名。有一位才华横溢、风尘仆仆的才子，游历天下，来到此山，他无意之中在山的洞中得到了神奇的功法。这位才子名唤韩真，精通五行之术，钻研各类兵法、阵法。他深知天下众生，遭受妖魔鬼怪侵犯，百姓生老病死、饥寒交迫。韩真一心想要拯救天下众生，于是就隐藏在通灵洞闭关潜心修炼。
他一闭关便是数十载，六十年后，正值夜晚月色正盛时，洞口忽然“轰轰轰”的声音作响，一个白色身影瞬间来到了山的顶峰。那个白色身影的就是韩真老人，此时，他已苍颜白发，白色胡须已然稍长，他站在那里，可谓具有一副仙风道骨的样子。他伸双手对着皎洁的月亮，好像在施展内功修为。谁知，他便借助月光灵力为此山布下了结界。过了好久，他双眼一闭，掐指一算，仿佛算到了什么。
韩真在山上自立门户，创建了各种各样的房屋、长亭、阁等，把此山取名为灵真山，于是创立了修仙正道门派——灵真。世人尊称他为通真老祖。后来他在通灵峰上建造了大殿——玄灵殿。
通真老祖深知人不能长生不死，算到自己迟早要羽化登仙，便下山寻找有缘人收归门下。当他找到有缘人后，便传授他法术和阵法。他告诫弟子要心怀天下，扶助百姓于水火。他随即掐指一算说：“千百年后，我派将有一场浩劫，此事早已命中注定，所以我不得不将毕生功力传授于你。你勿要辜负我的一片苦心，切记切记！”那位有缘人谨遵通真老祖教诲，通真老祖这才安然离开了。于是，第二代掌门专注于修行，在通真老祖传给他的几部功法中，他又从中悟出了灵真剑法，此剑法借助天地之灵气汇聚于剑中，威力强大！之后他下山历练，在机缘巧合之下，遇到了凶猛的灵兽——天雷灵龙兽。天雷灵龙兽，一只庞然大物，两只天蓝的龙角可以释放天雷之力，四只龙腿粗壮高大，犹如大树一般高，口中可以释放玄水，威力强大，长达百米的龙尾也可以攻击敌人，并释放雷电，强悍至极，身上的鳞甲更是无坚不摧。第二代掌门为了使本门派发展壮大，不惜耗损修为与天雷灵龙兽苦战七七四十九天，最终收服了这头灵兽，并让它守护在灵真山的幻月湖中，保护灵真门，成为灵真门的守护神。第二代掌门被尊称为玉真子。
玉真子收留了三个弟子，大弟子性格刚烈，修为极高；二弟子性格沉稳，精通剑法、功法，是玉真子最喜欢、最重视的弟子；第三个弟子性格洒脱，喜欢钻研机关八卦。玉真子仙逝后，把掌门之位传给二弟子张晓宇。他便成了第三代掌门，他在掌门之位更是不负玉真子所托，修习功法，研究剑法。过了二十年，他游遍天下，在历练当中得到各类名剑。其中就有一把上古神器——轩辕剑。轩辕剑，黄金色的千年古剑，传说是天界诸神赐于轩辕黄帝击败蚩尤的旷世神剑;其内蕴藏着无穷的力量，为斩妖除魔的神剑。由于轩辕剑的威力极大，并非常人所能控制的。张晓宇在离世之前便封印了此剑，藏于后山的通灵洞中。后来无人知晓轩辕剑的真正模样。张晓宇在当掌门之时，为了壮大灵真门的势力，他设立刑罚措施，通过比武选拔人才，于是每五十年便举行一次五行仙剑会。于是在第三代掌门之后就拥有了五位首领，按照金木水火土，德高望重者便是新的掌门。那时候就有了修仙得道的高人。在第六代掌门——恒心真人，他花费百年时光，在历代掌门传下来的修仙秘诀中，创下了不少剑法，并悟出了新的法术，也包括禁术。他将这些全部传给了弟子，并希望他的弟子能够勤学苦练，保天下太平。恒心真人在当上灵真门掌门之时，更是励精图治，将灵真门发展壮大。他曾经拿着凌璇剑与邪灵老人大战了三天三夜，打败了邪灵老人。后来，他门下的一位弟子修炼功法，险些走火入魔。在修仙一途，凡是修道之人，一旦受伤之后，不宜修炼剑法，功法，否则，心脉受损，后果不堪设想。于是，恒心老人为了不让后代弟子们误入歧途，在通灵洞府中潜心修炼，研究解决之法。二十年后，他终于研究出了一套剑法——镜花水月。
一千二百年后，在灵真战场发生了一次正魔大战，灵真门第十二代掌门云岚率领弟子与魔教展开惨烈的战争，双方均损失惨重。云岚掌门不忍看到这样的现状，又担心会危及天下众生，全力以赴，手持灵真剑，施展法术，将灵真剑变幻成许多剑刃向魔教众徒射去，打倒无数魔教弟子。忽然，魔教最高首领魔皇出现，与云岚掌门交锋在一起，大战了三百回合，都没有击退对方。云岚掌门最后不得不拿出本派至宝——玄灵镜，他施法使用玄灵镜发出五颜六色光芒攻击魔皇，魔皇用他那魔教镇宝——伏天铃将自己