艾克斯战败，一体化融合器被封印了。大地一脸悲怆地望着那位邪恶至极的魔鬼，黑暗迪迦。他几乎要失去了奋战下去的念头，这个恶魔比起之前的终极之战虚无还要可怕。就像一望无际的黑暗之云，吞没了艾克斯的光，连生存的意志都要消失殆尽了。
“杨云，现在你知道了吧。当初我化身成光的英雄战士，准备去带领旧人类走出黑暗一直都是对的。扫清了这一障碍，接下来就是大清洗了。出现吧，梦幻之花齐结拉。”
黑暗迪迦手臂一挥，一大片黑暗能量奔涌而至，接着光焰升腾了起来原地出现了一只超古代花型怪兽。
齐结拉花苞张开，一股股黄色烟雾弥漫了开来。由正木敬吾入主的黑暗迪迦释放了古代的毁灭使者梦幻之花。
“哥莫拉震动波。”
另外一边，地球护卫队的明莫拉共鸣，一头造型华丽的机械哥莫拉朝着齐结拉冲了过去。
梦幻之花齐结拉挥舞着两根藤蔓缠绕而上，任凭哥莫拉震动波一次次振荡，那些藤蔓却是相应的不断生长根须。终于在一道道黄色电光奔涌之下，一体化的电子哥莫拉消散了。
“大地，我……、”
电子机械哥莫拉消失，明日奈也遭到了重创昏迷不醒。随着梦幻之花花粉四散开来，就连大空大地也陷入了迷幻境地中。杨云遭受到了史上最大的危机，他不知道自己该为谁而战了，真理奈也被花粉拉进了梦境里。
望了一眼手臂处的水晶，这是源自黑暗诺亚的能量。继承了这份黑暗之力，他到底该不该去面对这残酷的现实呢？
“拥抱黑暗，化为光明。真的可以办得到么？”
嗖的一下，突然天空上一道黄金光辉从天而降。模糊不清的光影一步步走近，来到了杨云的面前。正是昔日的光之战士迪迦，大古。
“杨云你准备放弃了么？和我一起经历了那些岁月。即便是堕入了黑暗魔神，你也是可以选择的。光与暗，从来都不是问题。重要的是你的心选择了哪一方。”
“大古。我没你那么坚强不屈，一次次的被打倒，还能站起来。如果我化身成黑暗，失去了奋战之心，还能记得你和她们的容貌么？”
杨云轻语，从第一天开始他就一直把自己定位为辅助角色，不到万不得己时，绝不会动用帝皇铠甲和修罗帝器。现在又被黑暗魔神浸染了诺亚水晶。他不知道自己还能为谁而战，丽娜、雪梨她们为他的黑暗诺亚之躯所恐惧，真理奈昏迷在了一旁，至今未能醒转。
“不、每个人心中都会存在光明，一望无际的黑暗世界里，不也正好衬托出了光辉的可贵之处嘛。人们常说迪迦是神圣而又崇高的光，为人类跨入新领域时代做出了不可估量的贡献。但是我却只能说，因为有了你们，迪迦才能绽放光芒。基里艾洛德二世、机械岛和最终之战，是你们一次次默默地支持着我前进，黑暗诺亚。用你的光照耀出这片黑暗吧。”
一团金焱燃烧了起来，闪耀迪迦投影过来的虚幻光影淡化了。被染成了黑色的诺亚战神水晶绽放光芒，大地上一道百米身影轰然落地。比大山还要巍峨高大的躯体上面，由原来的黑紫色又多出了一条条血色丝线。遍布整具躯壳之间，杨云入主了黑暗诺亚体内。感受着这股纵横激荡的黑暗能量，心中的杀戮意志渐渐地沉淀了下来。
“拥抱黑暗，化为光明。只要保留了那颗守护之心，堕向了黑暗又如何。”
齐结拉树藤奔涌，钻出了地表直奔面前的黑色巨人躯体缠绕而去。黑暗诺亚巍峨不动如山，任凭一根根藤条涌了上来。接着他胸口部位的黑暗计时器亮起了一圈圈光晕，笼罩向整片大地的黑暗魔气尽数归拢入了其躯体内部。
黑暗魔神强悍的不死不灭之躯爆发了一团旋风，紫色旋风光刃将树根藤蔓齐根斩断。
“黑暗闪电。”
双手交汇之处，光与暗的交界线泾渭分明，黑暗诺亚的躯体上面爆发了一团明亮的银色光华。由最核心的v形指示器处亮起，迅速蔓延了开来。
一条条银色丝线和血光交融，刷的一下子整具黑色巨人之躯化为亮银。完美而又纯正的亮银色躯体，趋近于完美状态的光之战神诺亚展开绝杀。
血色雷光狂涌，如同万马奔腾一般的光暗两色能量涌来。双臂合一，形成了拳头状。一道无与伦比的闪电状流光轰在了齐结拉花苞处，将其炸成了粉末。
“拔它的根，暗耀诺亚。”
不知何时，真理奈从梦之幻境苏醒了过来。她偏着头嫣然一笑，并给他取名为了暗耀诺亚的称号。被银光与紫晕渲染得无比奇异的亮银色巨人一次飞扑，将齐结拉缩入了地底的根须抓起。
“逆暗为光。诺亚闪电。”
亮银色巨人胸口能量开始奔涌，全部汇入了那处根须部位。由黑暗迪迦召唤来的迷幻之花轰隆隆齐根炸裂开来。
这时，好像是因为第一次爆发了如此巨大的能量，他那高达百米的亮银色巨人之躯转变为了暗紫色。光暗两种正反相冲、截然不同的能量交汇于一处，在其血色指示器部位闪亮。
诺亚与扎基，前者为战神，后者是黑暗魔神。而杨云原先领悟了光，后来魔化堕落为了黑暗。现在光暗同存一体，相互冲撞出的雷电之力才是真正属于它的本源能量。
“为什么？杨云，你我同属黑暗一方阵营，却要和我作对。我多么希望这份伟大的事业，