观之原著也能发现，贝加庞克和【消音】军之间的关系并不是那么简单。“草帽”路飞作为世界政府重点缉拿名单上的通缉犯，堂堂海军本部科学部队的首席科学家，贝加庞克没有理由同意熊最后的请求，保护桑尼号直至他们归来。
世界政府与海贼永远是对立的，熊这个原型机两年未归，他们不可能没有发现其中的猫腻。然而现实就是这样，桑尼号依旧平安的渡过了那两年，直到弗兰奇回到桑尼号，这才返回海军本部。
贝加庞克在这其中发挥的作用，可比原著里一笔带过的，还要大的多。而其本身与【消音】军的联系，便足以解释这冒险性举动的缘由。
为了阻止研究继续，贝加庞克也算是费尽心机。